פרוץ המלחמה וכיבוש השטחים במזרח הפכו את מליוני היהודים, שעליהם איים היטלר בנאומו, ברייכסטאג בינואר 1939 לבני
ערובה,
בידי הנאצים, ואפשרו את מימוש התוכניות שהיו בתורת הגזע הנציונל-סוציאליסטית מלכתחילה. דברים שהיו בחזקת תיאוריה, יכלו עתה לצאת לפועל. כדי להבין את התוכנית הרצחנית והמדהימה וחסרת תקדים בתולדות האנושות, שנודע ברבות הימים במסווה של הכינוי "
הפתרון הסופי של יהדות אירופה", יש להבין את דרכי תפקודה של המדינה הנציונל-סוציאליסטית בכללותה ושל הממונים על רציחת היהודים בפרט.
ב1933- עד 1939 אופיינו כפי שראינו, ע"י הוצאת היהודים מגוף האומה ומגדר
האנושות, באמצעות שלילת זכיותיהם האזרחיות והכלכליות. הפתרון, שאליו חתרו באותו תקופה התמקד בעידוד הגירתם וגירושם לארצות אחרות, תוך כדי גזלת רכושם. עד שלב "הפתרון הסופי" היגרו מה"רייך" כמחצית מיהודי גרמניה וכשני שליש מיהודי אוסטריה. פרוץ המלחמה ביטל אפשרויות הגירה שהיו קיימות עד אז, ולעומת זאת פתח להכוונת היהודים לשטחי הכיבוש. בתקופת הביניים שבין 1939 ל1941- הועלו תוכניות דמיוניות למחצה, שהציעו ריכוז היהודים בשטחים המזרחיים של פולין או באי מדגסקר, מתוך טענה שהיהודים יוחזקו שם כעבדים במכלאה עד מותם, בלי שישאיר להם פתח לשיבה לחיים נורמליים, ואילו בעיצומה של המלחמה התגבשה התוכנית בדבר רצח שיטתי וטוטאלי, במיוחד כאשר בתנאי המלחמה ההולכת ומחריפה. נחלשו מעצורים מסוימים, שיתכן שהיו קיימים קודם לכן, ולא היה עוד צורך להתחשב כלל בדעת הקהל במדיניות הדמוקרטית. האחריות הבלעדית לביצוע התוכנית נמסרה לידי ה-SS והמשטרה.
ה-SS פלוגות הסער, שהיוו יחידה עילית של התגשמות האידיאולוגיה הנציונל-
סוציאליסטית, הפכו עם הזמן למעין מדינה בתוך מדינה ברייך השלישי.
הקמתה של רשת חינוך נפרדת, הקמה ומסירה לשליטתם של מחנות הריכוז בתוך גרמניה, אימפריה כלכלית משלהם שהייתה צריכה להפוך את ה-SS לבלתי תלויים בתקציב, בתעשייה ובהספקת הנשק הכללית של גרמניה. דברים אלו הפכו את היחידה הזו למכשיר רב כוח ועוצמה, ולזרוע ביצועית של התוכניות מרחיקות לכת ביותר, אפילו במושגים של הרייך השלישי.
כפי שראינו, הנחות היסוד של האידיאולוגיה הנאצית הוציאו את היהודים מכלל החברה האנושית והטביעו
עליהם חותם של טפילים וקושרים פוליטיים מסוכנים המאיימים על העולם, החינוך וההסברה הנאצית החדירו למוחות הגרמנים את התפיסה שדמם של יהודים מותר וכי סילוק יהודים הוא עקירה של חיידק המכלה את הגוף האנושי. התקפות הבזק וכיבוש ארצות, הקנו להיטלר מעמד של מנהיג שאינו טועה לעולם ושאין לערער על החלטותיו. בנאומו ב30 בינואר 1939,חודשים אחדים לפני פרוץ המלחמה,
אמר היטלר אותו משפט שצוטט לעיל, המדבר במפורש על השמדת הגזע היהודי באירופה.
שני דברים יש בנבואה אימתנית זו של היטלר:
1) כאשר תפרוץ המלחמה, ואין זה משנה מי יהיה הצד התוקף והמחולל את מעשי האיבה, תוטל על היהודים האשמה והם ישלמו בחייהם על "אחריותם".
2) לא רק יהודי גרמניה יישאו את העונש באיום זה, אלא החשבון ייעשה כל יהודי
אירופה.
עם "מבצע ברברוסה" וכיבוש המזרח נפלו בידי הגרמנים כשני מליון יהודים נוספים.
החלו מיד בתהליך הגטואיזציה והוחלו עליהם כל אותן הגזירות שנגזרו על יהודי
גרמניה ופולין, לפי פקודת הימלר נתלוו לצבאות הכיבוש "עוצבות מבצע" של ה-SS.
הוטלו עליהם שלוש משימות:
א) רצח המוני יהודים בירי.
ב) הסתת האוכלוסייה המקומית לבצע פוגרומים ביהודים.
ג) העברתם של היהודים לגטאות ההולכים ומוקמים. מדו"חות "עוצבות מבצע" של ה-SS.
כינו את הרצח ההמוני של גברים, נשים, ילדים, זקנים וחולים יהודים בשם "חיסול", מתברר כי יחידה א'' "חיסלה" 135,567 איש, יחידה ב'' דיווחה על 45,426 ובסך-הכול נהרגו בידי עוצבות המבצע בשלבים הראשונים כמיליון יהודים.